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哪个部门办理《动物检疫合格证明》
可以到当地的动物卫生监督所申请办理《动物检疫合格证明》。
办理流程：
1、到当地的动物卫生监督所申请；
2、到当地动物卫生监督所指定兽医机构进行检测，并交纳检测费用；
3、持兽医部门出具的检测报告到当地的动物卫生监督所申请办证。
（一）动物检疫审批
1、来自非封锁区或未发生相关动物疫情的饲养场（养殖小区）、养殖户；
2、动物按照国家规定进行强制免疫，并在有效保护期内；
3、养殖档案相关记录和畜禽标识符合农业部规定；
4、动物临床检查健康；
5、需进行实验室疫病检测的，检测结果合格；
6、种用、乳用动物须符合相应的动物健康标准；精液、胚胎、种蛋的采集、移植、消毒记录完整，其供体动物符合相应的动物健康标准；
7、跨省调运种用、乳用动物及其精液、胚胎、种蛋的，应先取得输入地省级动物卫生监督机构的审批同意；
8、农业部规定的其它条件
（二）动物产品检疫审批
1、经检疫合格的动物产品到达目的地后，需要直接在当地分销的：
（1）提供原始有效《动物检疫合格证明》，检疫标志完整，且证物相符；
（2）在有关国家标准规定的保质期内，且无腐败变质。
2、经检疫合格的动物产品到达目的地，贮藏后需继续调运或者分销的
（1）提供原始有效《动物检疫合格证明》，检疫标志完整，且证物相符；
（2）在有关国家标准规定的保质期内，无腐败变质；
（3）有健全的出入库登记记录；
（4）农业部规定进行必要的实验室疫病检测的，检测结果符合要求。《动物检疫合格证明》由动物卫生监督机构官方兽医出具的，标示某一动物及其产品检疫合格的证明。《动物检疫合格证明》是动物卫生监督证章标志的一种，共有两类四种，即动物检疫合格证明(动物A)、动物检疫合格证明(动物B)，动物检疫合格证明(产品A)、动物检疫合格证明(产品B);即A类和B类，动物和动物产品。具体为:动物检疫合格证明(动物A)和动物检疫合格证明(产品A)适用于跨省境出售或者运输动物及其动物产品。动物检疫合格证明(动物B)和动物检疫合格证明(产品B)适用省内出售或者运输动物及其动物产品。
法律分析：动物、动物产品检疫合格证办理流程：
1、申请人申报检疫。动物产品、供屠宰或者育肥的动物提前3天申报;种用、乳用或者役用动物提前15天申报;因生产生活特殊需要出售、调运和携带动物或者动物产品的，随报随检。
2、动物卫生监督所接到申报后，派2名以上动物检疫人员到现场实施检疫。
3、检疫合格的动物或动物产品出具《动物检疫合格证和《动物产品检疫合格证，加施检疫标志。
4、检疫不合格的动物、动物产品，按有关规定处理。
5、检疫存根归档
法律依据：《中华人民共和国动物防疫法》 第四十二条 屠宰、出售或者运输动物以及出售或者运输动物产品前，货主应当按照国务院兽医主管部门的规定向当地动物卫生监督机构申报检疫。
《动物检疫管理办法》
第八条 下列动物、动物产品在离开产地前，货主应当按规定时限向所在地动物卫生监督机构申报检疫：
（一）出售、运输动物产品和供屠宰、继续饲养的动物，应当提前3天申报检疫。
（二）出售、运输乳用动物、种用动物及其精液、卵、胚胎、种蛋，以及参加展览、演出和比赛的动物，应当提前15天申报检疫。
（三）向无规定动物疫病区输入相关易感动物、易感动物产品的，货主除按规定向输出地动物卫生监督机构申报检疫外，还应当在起运3天前向输入地省级动物卫生监督机构申报检疫。
第九条 合法捕获野生动物的，应当在捕获后3天内向捕获地县级动物卫生监督机构申报检疫。
第十条 屠宰动物的，应当提前6小时向所在地动物卫生监督机构申报检疫；急宰动物的，可以随时申报。
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